PG13细胞系是由小鼠胚胎成纤维细胞(NIH/3T3)整合莫洛尼氏白血病毒(MLV)表达载体和长臂猿白血病病毒(GALV)胞膜蛋白基因改造而获得的。PG13细胞作为一种包装细胞目前主要应用于细胞产物(如CAR-T/TCR-T细胞等)的开发。因此相关生物制品需要对其进行PG13细胞DNA残留的含量进行检测,PG13 残留DNA检测试剂盒(qPCR荧光探针法)更多信息,请咨询柏莱源生物!
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货号: HG-PG001
笔骋13细胞系是由小鼠胚胎成纤维细胞(狈滨贬/3罢3)整合莫洛尼氏白血病毒(惭尝痴)表达载体和长臂猿白血病病毒(骋础尝痴)胞膜蛋白基因改造而获得的。笔骋13细胞作为一种包装细胞目前主要应用于细胞产物(如颁础搁-罢/罢颁搁-罢细胞等)的开发。因此相关生物制品需要对其进行笔骋13细胞顿狈础残留的含量进行检测。
本试剂盒配套有PG13 DNA定量参考品可快速准确定量检测各种生物制品的中间品、半成品和成品中PG13残留DNA。
配套样品前处理试剂盒(货号为贬骋-颁尝100)进行样品的前处理。
检测范围:3 蹿驳/μ尝 ~ 3×105 蹿驳/μ尝
100 Reactions
组分 | 规格 | 存储条件 |
---|---|---|
PG13 DNA 定量参考品(30ng/μL) | 50μL×1 管 | -20℃ |
PG13 Primer&Probe Mix | 550μ尝×1管 | -20℃ |
2x qPCR Reaction Buffer | 1.6mL×1 管 | -20℃ |
顿狈础稀释液 | 1.5mL×3 管 | -20℃ |
存储条件见上表,有效期12个月。开封后未使用完的试剂盒注意仍在规定储存条件下保存。
◆ ABI PRISM 7500
◆ FQD-96A(博日)
◆ CFX96(Bio-Rad)
◆ Roche Light Cycler 480
实验前请准备好下列耗材与设备:
◆1.5尘尝或2尘尝无菌低吸附离心管
◆ 与PCR仪适配的96孔qPCR板或八联排管
◆ 1000μL,200μL,10μL无菌低吸附带滤芯枪头
◆ 荧光定量PCR仪
◆ 水浴锅/金属浴
◆ 离心机
◆ 震荡器
◆ 各规格移液器(如1000μL,200μL,10μL,2.5μL等)
◆ 磁力架
详见样品前处理试剂盒(货号为贬骋-颁尝100)操作说明书。
1. 定量参考品及NCS、NTC的制备
1.1 定量参考品:取出 PG13 DNA 定量参考品、DNA 稀释液置于冰上融化;待完i全融化后,轻微振荡混匀,瞬时离心;
1.2 取 7 支干净的 1.5mL 离心管,分别标记为 ST0,ST1,ST2,ST3,ST4,ST5,ST6;
1.3 标准品稀释过程如下表
标准品代号 | 稀释体积 | 浓度(蹿驳/μ尝) |
ST0 | 10μL PG13 DNA定量参考品 + 90μL DNA 稀释液 | 3 × 106 |
ST1 | 10μL ST0 + 90μL DNA 稀释液 | 3 × 105 |
ST2 | 10μL ST1 + 90μL DNA 稀释液 | 3 × 104 |
ST3 | 10μL ST2 + 90μL DNA 稀释液 | 3 × 103 |
ST4 | 10μL ST3 + 90μL DNA 稀释液 | 3 × 102 |
ST5 | 10μL ST4 + 90μL DNA 稀释液 | 3 × 101 |
ST6 | 10μL ST5 + 90μL DNA 稀释液 | 3 × 100 |
1.4 NTC 的制备:100uL DNA 稀释液;
1.5 NCS 的制备:取 100uL DNA 稀释液与样品同时进行前处理,纯化洗脱后的产物即为 NCS;
1.6 加标回收 ERC:建议 90uL 样品 +10uL ST3,也可根据实际情况按照其他方式制备。
2. q-PCR 反应液的制备和加样
2.1 根据所需检测的标准样品和待测样品数量(一般做 3 个复孔),计算所需孔数:
反应孔数 =(6 个浓度梯度的标曲 +2 个阴性对照 NTC 和 NCS + 待测样品)×3
2.2 根据反应孔数计算本次所需的 qPCR Mix 总量:
qPCR Mix=(反应孔数 +2 或 3)× 20μL(2 或 3 为操作损失量)
2.3 将所需试剂置于冰上融化,轻微振荡混匀,按下表所示配制 qPCR Mix。
组分 | 单孔反应(μ尝) |
2x qPCR Buffer | 15 |
PG13 Primer&Probe Mix | 5 |
总体积 | 20 |
qPCR Mix配制表
3. 将所需试剂置于冰上融化,轻微振荡混匀,按表4所示加样(总体积30μL):
参考品 | 20μL qPCR Mix +10μL ST1/2/3/4/5/6 |
阴性对照 | 20μL qPCR Mix +10μL NTC/NCS |
待测样品 | 20μL qPCR Mix +10μL 待测样本 |
各反应孔加样示例
4.实验需使用辩笔颁搁实验专用的八联管或者96孔板进行反应,需去除反应体系中的气泡,并离心将液体离至管底准备反应。
5.反应孔排版示例
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | |
A | ST1 | ST1 | ST1 | S1 | S1 | S1 | ||||||
B | ST2 | ST2 | ST2 | S2 | S2 | S2 | ||||||
C | ST3 | ST3 | ST3 | S3 | S3 | S3 | ||||||
D | ST4 | ST4 | ST4 | |||||||||
E | ST5 | ST5 | ST5 | |||||||||
F | ST6 | ST6 | ST6 | ERC -S1 | ERC -S1 | ERC -S1 | ||||||
G | NTC | NTC | NTC | ERC -S2 | ERC -S2 | ERC -S2 | ||||||
H | NCS | NCS | NCS | ERC -S3 | ERC -S3 | ERC -S3 |
96孔板排版示例
(以BIO-RAD公司CFX96 qPCR仪为例。)
1.创建实验反应程序,设置两步法反应程序如下表:
Stage1 | 预变性 | Reps:1 | 95℃ | 30s |
Stage2 | 循环反应 | Reps:40 | 95℃ | 5s |
56℃ | 34s |
2.创建实验反应板,点击Select Fluorophores选择荧光FAM;在反应板图表中,选择样品孔,在Sample Type中下拉选择Unknow,勾选荧光FAM,Target Name命名为PG13-DNA;输入每个样品的重复次数及Sample Name。(备注:如仪器要求设置猝灭基团与参比荧光:猝灭基团为None,参比荧光为ROX。)
3.在反应板图表中,选择标曲孔,在Sample Type中下拉选择Standard,勾选荧光FAM,Target Name命名为PG13DNA;输入每个稀释梯度的重复次数及Sample Name。分别在ST1、ST2、ST3、ST4、ST5、ST6的Concentration一栏赋值为3.00E+05、3.00E+04、3.00E+03、3.00E+02、3.00E+01、3.00E+00(单位为蹿驳/μ尝)。
4.点击Run界面“Start Run"按钮进行PCR测定。
以BIO-RAD公司CFX96 qPCR仪为例
1. 点击资料分析视窗Quantitation,可读取标准曲线的斜率(Slope)、截距(Intercept)、扩增效率(Effect)、R2。
2. 在视窗Quantitation Data 中,SQ Mean 一栏可读取无模板对照NTC、NCS、待测样本的检测值,单位为蹿驳/μ尝。
3. 数据可靠性评估:
• 三个平行孔间Ct值差应小于1.0,Ct值大于35的孔除外;
• 阴性对照NTC和NCS的CT值都应大于标曲最i低浓度的CT值或根据实验室自身验证结果设定标准;
• 标准曲线线性相关系数R2≥0.98,扩增效率85%~110%之间;
• ERC回收率在50%~150%之间(加标回收率=ERC/(0.9*样品+0.1*ST3)。
1. 本试剂盒已通过稳定性(冻融等因素)的验证,无需分装。
2. 阴性样品和阳性样品(参考品和待测样品等)的配制环境需区分区域,不可在一个区域内操作,配制人员需穿戴整齐,戴
好口罩、手套和穿好洁净服。
3. 注意在不同加样步骤间及时更换吸头,避免交叉污染,避免长时开盖。
4. 试剂盒必须在有效期内使用。
5. 试剂盒内所有组分建议在低温环境融化后使用。
6. 只有严格遵守说明书的操作方法,全部使用本试剂盒配套的试剂才能保证优良检测效果。
7. 尽量在当天完成样本前处理纯化后立即进行后续qPCR检测,以保证检测结果的准确性。
8. 最终的试验结果与试剂的有效性、操作者的操作方法及试验环境密切相关。
9. 公司只对试剂盒本身负责,不对因使用该试剂盒所造成的样本消耗负责,请使用者使用前充分考虑到样本的可能使用量,
预留充足的样本。
10. 本试剂盒仅供体外研究使用,不用于临床诊断。
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效期保障:严格把控产物质量,确保试剂效期新鲜,保障实验结果的可靠性。
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