CAR/TCR 基因拷贝数检测试剂盒是用于定量检测来源于 HIV-1 型慢病毒载体技术制备的 CAR-T/TCR-T/CAR-NK 细胞基因组中CAR 基因拷贝数检测的专用试剂盒。
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货号: HG-CA001
本试剂盒用于核酸的提取、富集、纯化等步骤,其处理后的产物可用于临床体外检测使用。
本试剂盒使用超顺磁性微球可以特异性的吸附 DNA,通过洗涤去除 DNA 以外的蛋白质等杂质。洗脱液解离吸附在磁珠上的DNA,分离纯化得到高质量核酸。
检测范围:3×101 肠辞辫颈别蝉/μ尝词3×106 肠辞辫颈别蝉/μ尝
100 Reactions
组分 | 规格 | 存储条件 | |||
---|---|---|---|---|---|
CAR 定量参考品(3×108 肠辞辫颈别蝉/μ尝 ) | 50μL×1 管 | -20℃ | |||
CAR Primer&Probe Mix | 550μL×1 管 | -20℃ | |||
2× qPCR Reaction Buffer | 1.2mL×1 管 | -20℃ | |||
DNA 稀释液 | 1.5mL×3 管 | -20℃ | |||
ROX High | 50μL×1 管 | -20℃ | |||
ROX Low | 50μL×1 管 | -20℃ |
存储条件见上表,有效期 18 个月。
◆ ABI PRISM 7500
◆ FQD-96A(博日)
◆ CFX96(Bio-Rad)
◆ Roche Light Cycler 480
配合不同机型使用时,请注意选择适配的参比染料 ROX
仪器 | 搁翱齿参比染料 |
Applied Biosystems®5700,7000,7300,7700,7900HT,StepOneTM,and StepOnePlusTTM | ROX High |
Applied Biosystems®7500,ViiATM 7,QuantStudioTM12K Flex,Agilent Mx3000PTM,Mx3005PTM,and Mx4000TM | ROX Low |
Rotor-GeneTM,DNA Engine OpticonTM,OpticonTM2,Chromo 4TMReal-Time Detector,Mastercycler®ep realplex, Smart Cycler®,Roche LightCycle®480,Roche LightCycler®Nano,Bio-Rad CFX96,and llumina EcoTM | No ROX |
◆ 1.5mL 或 2mL 无菌低吸附离心管
◆ 离心机
◆ 荧光定量 PCR 仪
◆ 与 PCR 仪适配的 96 孔 qPCR 板或八联排管
◆ 震荡器
◆ 1000μL,200μL,10μL 无菌低吸附带滤芯枪头
◆ 各规格移液器(如 1000μL,200μL,10μL,2.5μL 等)
详见血液 / 组织 / 细胞基因组 DNA 纯化提取试剂盒(货号为 HG-NA100)操作说明书。
1.1 定量参考品:取出 CAR 定量参考品、DNA 稀释液置于冰上融化;待完i全融化后,轻微振荡混匀,瞬时离心;
1.2 取 7 支干净的 1.5mL 离心管,分别标记为 ST0,ST1,ST2,ST3,ST4,ST5,ST6;
1.3 标准品稀释过程如下表:
标准品代号 | 稀释体积 | 浓度(肠辞辫颈别蝉/μ尝) |
STO | 10μL定量参考品+90μL DNA稀释液 | 3×10? |
ST1 | 10μL STO+90μL DNA稀释液 | 3×106 |
ST2 | 10μLST1+90μL DNA稀释液 | 3×10? |
ST3 | 10μL ST2+90μL DNA稀释液 | 3×10? |
ST4 | 10μL ST3+90μL DNA稀释液 | 3×10? |
ST5 |
|
|
ST6 | 10μL ST5+90μL DNA稀释液 | 3×10? |
1.4 NTC 的制备:100uL DNA 稀释液;
1.5 NCS 的制备 : 随样品取 100μL DNA 稀释液进行样品预处理。
2.1 根据所需检测的标准样品和待测样品数量(一般做 3 个复孔),计算所需孔数:
反应孔数 =(6 个浓度梯度的标曲 +2 个阴性对照 NTC 和 NCS + 待测样品)×3
2.2 根据反应孔数计算本次所需的 qPCR Mix 总量:
qPCR Mix =(反应孔数 +2 或 3)× 15μL(2 或 3 为操作损失量)
2.3 将所需试剂置于冰上融化,轻微振荡混匀,按下表所示配制 qPCR Mix。
组分 | 单个反应量 (μL) |
2× qPCR Reaction Buffer | 10 |
CAR Primer&Probe Mix | 4.6 |
ROX* | 0.4 |
总体积 | 15 |
参考品 | 15μL qPCR Mix +5μL ST1/2/3/4/5/6 |
阴性对照 | 15μL qPCR Mix +5μL NTC/NCS |
待测样品 | 15μL qPCR Mix +5μL 待测样本 |
各反应孔加样示例
4.实验需使用辩笔颁搁实验专用的八联管或者96孔板进行反应,需去除反应体系中的气泡,并离心将液体离至管底准备反应。
5.反应孔排版示例
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | |
A | ST1 | ST1 | ST1 | S1 | S1 | S1 | ||||||
B | ST2 | ST2 | ST2 | S2 | S2 | S2 | ||||||
C | ST3 | ST3 | ST3 | S3 | S3 | S3 | ||||||
D | ST4 | ST4 | ST4 | |||||||||
E | ST5 | ST5 | ST5 | |||||||||
F | ST6 | ST6 | ST6 | ERC -S1 | ERC -S1 | ERC -S1 | ||||||
G | NTC | NTC | NTC | ERC -S2 | ERC -S2 | ERC -S2 | ||||||
H | NCS | NCS | NCS | ERC -S3 | ERC -S3 | ERC -S3 |
96孔板排版示例
(以BIO-RAD公司CFX96 qPCR仪为例。)
1.创建实验反应程序,设置两步法反应程序如下表:
Stagel | 预变性 | Reps:1 | 95℃ | 10min |
Stage2 | 循环反应 | Reps:40 | 95℃ | 15s |
60℃ | 60s |
2.创建实验反应板,点击 Select Fluorophores 选择荧光 FAM 和 Cy5;
在反应板图表中,选择样品孔,在Sample Type中下拉选择Unknow,勾选荧光FAM,Target Name命名为Human-DNA;输入每个样品的重复次数及Sample Name;
在反应板图表中,选择标曲孔,在 SampleType 中下拉选择 Standard,勾选荧光 FAM,Target Name 命名为 CAR;勾选荧光 Cy5,Target Name 命名为 RFG,输入每个稀释梯度的重复次数及 SampleName。并且分别在 ST1, ST2, ST3,ST4,ST5,ST6 的 Concentration 一栏赋值为 3E+06、3E+05、3E+04、3E+03、3E+02、3E+01( 单位为 copies/uL) 。
3.点击 Run 界面“Start Run"按钮进行 PCR 测定。4.点击Run界面“Start Run"按钮进行PCR测定。
以BIO-RAD公司CFX96 qPCR仪为例
1. 点击资料分析视窗Quantitation,可读取标准曲线的斜率(Slope)、截距(Intercept)、扩增效率(Effect)、R2。
2. 在视窗Quantitation Data 中,SQ Mean 一栏可读取无模板对照NTC、NCS、待测样本的检测值,单位为肠辞辫颈别蝉/μ尝。
3. 数据可靠性评估:
• 三个平行孔间Ct值差应小于1.0,Ct值大于35的孔除外;
• 阴性对照NTC和NCS的CT值都应大于标曲最i低浓度的CT值或根据实验室自身验证结果设定标准;
• 标准曲线线性相关系数R2≥0.98,扩增效率85%词110%之间;
• ERC回收率在50%~150%之间(加标回收率=ERC/(0.9*样品+0.1*ST3)。
4. 结果计算:CAR 拷贝数 / 细胞 = 2 x CAR / RFG
1. 本试剂盒已通过稳定性(冻融等因素)的验证,无需分装。
2. 阴性样品和阳性样品(参考品和待测样品等)的配制环境需区分区域,不可在一个区域内操作,配制人员需穿戴整齐,戴
好口罩、手套和穿好洁净服。
3. 注意在不同加样步骤间及时更换吸头,避免交叉污染,避免长时开盖。
4. 试剂盒必须在有效期内使用。
5. 试剂盒内所有组分建议在低温环境融化后使用。
6. 只有严格遵守说明书的操作方法,全部使用本试剂盒配套的试剂才能保证优良检测效果。
7. 尽量在当天完成样本前处理纯化后立即进行后续qPCR检测,以保证检测结果的准确性。
8. 最终的试验结果与试剂的有效性、操作者的操作方法及试验环境密切相关。
9. 公司只对试剂盒本身负责,不对因使用该试剂盒所造成的样本消耗负责,请使用者使用前充分考虑到样本的可能使用量,
预留充足的样本。
10. 本试剂盒仅供体外研究使用,不用于临床诊断。
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